Pada tahun 1546 ia telah ditubuhkan di bandar Arica di tempat yang dipanggil El Chenchorro. Lima puluh tahun kemudian bandar itu dilanda gempa bumi dan tsunami, yang memaksa penduduk untuk bergerak rumah mereka ke pelabuhan di bawah perlindungan Cape Morro, di tempat di mana dia sekarang.

Bangunan semasa Katedral Arica dibina di atas runtuhan kuil kedua kota, yang dibina pada tahun 1640. Selepas 200 tahun perkhidmatan, gereja ini juga telah dimusnahkan oleh gempa bumi pada tahun 1868. Hanya dipelihara tangga batu. Projek bangunan gereja baru telah diarahkan oleh Presiden Peru Jose Balta di studio Perancis Gustave Eiffel, dan pada asalnya bertujuan untuk resort Ancon. Tetapi pada tahun 1875 ia telah memutuskan untuk membina di Arica. Satu tahun kemudian, kuil telah diadakan Mass pertama.

Semasa Perang Pasifik (1879-1883) mula milik kota Arica di Chile. Tetapi sehingga ketibaan abad kedua puluh, Arica kekal di bawah kepimpinan Diocese Arequipa, menurut firman Vatican City. Pada tahun 1910, Datuk Bandar bandar Arica, Maximo Lira, menetapkan pengusiran imam Peru dan pembantunya dari negara ini. Mereka telah digantikan dengan chaplains tentera Chile.

Pada tahun 1911 gereja bertugas di keuskupan Tarapaca (kini - Diocese Iquique). Dan pada tahun 1959 beliau telah dipindahkan ke pangkat Katedral. Dengan restu Pope John Paul II pada tahun 1986, ia telah diasaskan oleh Diocese Arica ke pusat bandar di Katedral St. Mark di Arica.

Gereja ini adalah agak kecil, dalam gaya Gothic. Reka bentuk gereja dibuat sepenuhnya daripada logam - rasuk, tiang, yang dihubungkan dengan gerbang tajam, kecuali dua pintu kayu. Menara kuil naik ke langit, memberikan keindahan dan kemegahan bangunan, yang dipertingkatkan dengan landskap sekitarnya: Plaza de Colón, Cape Morro de Arica, pelabuhan, pelabuhan dan laut terbatas.

Pada tahun 1984 bangunan Cathedral diisytiharkan sebagai monumen kebangsaan Chile. Dan pada tahun 2002 - monumen sejarah Arica.