Gereja San Miguel (Gereja San Miguel) dibina pada tahun 1630-an di Manila bagi mengiktiraf Sepanyol Gabenor Jeneral, yang nyaris maut semasa kempen ketenteraan. Gereja ini juga telah memberikan bantuan dan pertolongan kepada orang-orang Kristian Jepun yang melarikan diri daripada penindasan semasa pemerintahan feudal Tokugawa Shogunate. Oleh kerana ramai orang buangan ini adalah pahlawan samurai iaitu, gereja itu tertumpu kepada Archangel Michael (atau Miguel Suci dalam bahasa Sepanyol), syahid yang besar. Gereja masa ini, terkenal dengan menakjubkan simetri loceng kembar, yang dibina dalam gaya Baroque Eropah. Ia terletak berhampiran istana kerajaan Malakanang dan merupakan sebahagian mandatori program lawatan ini. Sebelum gereja dibahagikan persegi agak kecil dengan pokok-pokok tropika dan bunga dan mata air, yang mengharmonikan baik dengan bangunan agama.