Suwa-Jinja dibina pada penindasan terhadap orang Kristian, dan bertujuan untuk Jepun untuk kembali ke pangkuan salah satu agama tradisional - Shinto. Cuti dan perayaan-perayaan yang dijalankan di dalam rumah, terpaksa menunjukkan orang Eropah tiba di Nagasaki keindahan budaya Jepun. Hari ini Suva Shrine adalah kuil Shinto utama dan masyarakat Shinto pusat bandar. Ia terletak di bahagian utara, di lereng bukit Tamadzono-san ini. Untuk mendaki ke gereja, perlu pergi menaiki tangga 277 langkah.

Pembinaan kuil itu bermula pada 1614, apabila Gabenor Tokugawa Ieyasu yang mengeluarkan perintah, yang menjadi permulaan penganiayaan Kristian. Ieyasu dianggap penyebaran agama Eropah terlalu cepat dan agresif, dia melihat ia sebagai satu ancaman kepada agama tradisional, integriti masyarakat Jepun dan tatanegara. Pada masa ini mula membina tempat-tempat suci Shinto secara aktif dan Jepun mula memaksa pengakuan Shinto dan Buddha.

Sepuluh tahun kemudian, pada tahun 1624-m, tiba di bandar tokoh agama Aoki Kensei bahawa untuk menarik penduduk ke kuil baru mula menghabiskan yutate-sai - upacara di mana imam dicelup tangannya ke dalam air mendidih dan membawa mereka keluar tanpa membakar tunggal. Tetapi ini "menunjukkan" dalam bilangan umat boleh dikatakan tidak terjejas. Kemudian, pada tahun 1634 penduduk tempatan perlu mendaftar di gereja dan mula mengadakan perayaan besar pada musim gugur. Dengan kedua-dua langkah-langkah pihak berkuasa mendedahkan rahsia Kristian tidak berdaftar dan tidak menghadiri hari raya itu telah ditangkap, diseksa dan dibunuh.

Suva Suva Shrine khusus kepada dewa-no-Kami, yang dihormati sebagai tuhan yang gagah perkasa dan kewajipan, dan tempat perlindungan yang terletak di seluruh Jepun. Juga di dalam rumah ini ibadat dua dewa - Sumiyoshi, dewa laut, dan Moridzaki. Dalam penghormatan dari mereka memutuskan pada perayaan Kunti, yang paling terkenal sepanjang cuti Suva Shrine. Ia diadakan setiap tahun pada 7-09 Oktober dan dianggap sebagai satu perayaan besar dan terkenal seperti Gion Matsuri.

Pada masa ini, 3 Mac di gereja juga menjadi tuan rumah festival boneka di mana muda Jepun memakai wanita cuti kimono dan mengambil bahagian dalam perarakan itu. Untuk mengambil bahagian dalam proses ini, mereka lulus pertandingan itu, dan yang susulan daripada dua yang paling indah memilih peranan maharaja dan isterinya, yang mengetuai perarakan. Adalah dipercayai bahawa acara ini menggalakkan Shinto kuil.

Di Suva Shrine 9 Ogos setiap tahun mengadakan perkhidmatan peringatan bagi memperingati mangsa-mangsa bom atom. Upacara ini menggabungkan unsur-unsur Shinto, Buddha dan Kristian perkhidmatan semasa berdoa untuk lebih daripada 70 ribu orang yang meninggal dunia dalam serangan udara itu pada tahun 1945. Kuil ini terselamat bom atom, imamnya mengambil bahagian dalam pemulihan Nagasaki, menguduskan tanah dan membersihkan dari runtuhan.