Bandar ini merupakan pusat pentadbiran Otsu Shiga Wilayah. Dalam II dan VII berabad-abad di Otsu walaupun secara ringkas menjadi ibu negeri ini. Tukar modal biasanya berlaku selepas kematian bekas maharaja. Oleh itu, pada 667, mahkamah empayar berpindah dari Asuka di Otsu, yang selama lima tahun menjalankan fungsi modal. Kemudian kawasan itu sekali lagi menukar tempat mereka "terkehel" dan Otsu menjadi stesen pos pada saluran yang meriah di Tokaido.

Pada tahun 686 di Otsu ditubuhkan Biara Ondzёnzdi utama yang pertama, juga dikenali sebagai Mii-dera dan dipunyai oleh Tendai Buddha School. Satu ratus tahun kemudian berhampiran Mii-dera, di Gunung Hiei atas arahan Maharaja Kammu telah mendirikan rumah yang lain - Enryaku-ji, juga dipunyai oleh mazhab Tendai, tetapi untuk cawangan yang lain. Candi ini dibina untuk tujuan perlindungan rohani yang ketika itu di ibu kota Kyoto, dan ia bertujuan untuk melindunginya daripada roh-roh jahat yang datang dari utara-timur.

Monk pengasas Enryaku-ji menjadi Saicho, dibuat Tendai. Dalam masa kejayaannya, kompleks Kuil Enryaku-ji termasuk 3,000 kuil, biara dianggap sangat popular di kalangan golongan bangsawan Jepun, mendapat pendapatan yang baik, harta yang dimiliki sebenar di seluruh negara dan mempunyai beberapa keistimewaan. Pelajar Saicho selepas 12 tahun amalan rohani menerima jawatan dalam kerajaan.

Enryaku-ji didiami sami agak suka berperang yang, jika perlu, mengangkat senjata, dan tidak teragak-agak untuk menyelesaikan masalah mereka dengan itu. Enryaku-ji dianggap kuil utama mazhab Tendai, dan Mii-dera - lebih berkuasa dan kaya. Monks dalam dua biara selama lima abad (dari X ke XV abad) dalam keadaan konfrontasi bersenjata, menyerang antara satu sama lain, di mana musnah atau membakar satu dan kemudian biara lain.

Pada tahun 1571, dalam perang campur tangan penguasa Oda Nobunaga, juga api dan pedang untuk meneruskan dasar persatuan darat Jepun. Beliau mengepung biara Enryaku-ji itu, dihancurkan dan dibakar kebanyakan bangunannya. Di tengah-tengah abad XVII bangunan dipulihkan, termasuk dewan solat utama. Bangunan sekarang diiktiraf di Jepun, bangunan kayu yang ketiga terbesar dan menyatakan status harta negara.

Pada masa ini, kompleks kuil biara dibahagikan kepada tiga bahagian. Pemandangan yang paling menarik boleh dilihat di timur (Todo) dan barat (Saito) bahagian. Bahagian ketiga, Ёkava dianggap terpencil dan kurang menarik.