Gereja Hagia Sophia telah dibina pada pertengahan abad ke-VII di atas runtuhan tiga kali panjang gereja awal Kristian, dan dalam tempoh yang Byzantine ia dikelilingi oleh pelbagai bangunan sebagai kultus dan tujuan pentadbiran. Sejak 1585 gereja menjadi masjid, tetapi telah disucikan semula sebagai sebuah gereja pada tahun 1912.

Bukti sejarah dan arkeologi menunjukkan bahawa di nave 'dan di bahagian selatan deretan tiang St Sophia kuil telah dikebumikan metropolitan Thessaloniki, sebagai contoh, Grigoros Kutalis dan Konstantin Mesopotamitis.

Bahagian gereja dihiasi dengan pelbagai mosaik dan lukisan dinding abad IX-X. The fresco "The Ascension" menghiasi kubah gereja.